農學院成立于1996年，是東北農業大學骨干學院之一。農學院前身是1948年東北農學院建院時成立的三系之一 ——農藝系（后改為農學系），招收農學專業學生，王金陵教授任首任系主任。1956年增設了土地整理專業并招生。1958年2月，土地整理專業從農學系分出成立土地規劃系。1958年農學系在農學專業基礎上又增設了果蔬、植物保護、土壤農化3個專業并招生。1976年園藝專業從農學系分出，建立園藝系。1985年農學系增設農業教育專業專科三年，1988年省教委批復成立農業教育推廣系，從農學系分出，開始單獨招生。1989年，植保專業從農學系分出，建立了植保系。1990年，農學系在招收本科學生基礎上，經省教委批準招收農學專業專科生，至1995年最后一屆招生。1994年農學系設立農業環境保護專業并招生。1996年6月，學校決定由農學系、園藝系、植保系三系合并組建農學院。2000年10月，農學院又一分為三：園藝系分出建立園藝學院；土壤農化系、農業環保系、農業氣象教研室、農業生態教研室、農業微生物教研室從農學院分出組建資源與環境學院；原隸屬于農學院的實驗站劃分到學校，成立東北農業大學植物類實驗實習基地。余下各系成立農學院，2003年設立生物技術（植物）專業，共招生5屆，2009年成立種子科學與工程專業，2010年開始招收植物生產類撥尖人才培養班，2015年開設植物科學與技術專業，2016年開設農學專業本碩博連讀班。

農學院現有農學、植物保護、種子科學與工程、植物科學與技術4個系，農學、植物保護2個教學實驗中心，院辦公室和輔導員辦公室。擁有大豆生物學教育部重點實驗室、省部共建有害生物防治基礎實驗室、農業部北方大豆生物學與遺傳育種重點實驗室、農業部東北地區作物栽培科學觀測實驗站、植物科學與技術國家級實驗教學示范中心、東北農業大學——黑龍江省農業科學院綏化分院農科教合作人才培養國家級大學生校外實踐教育基地、東北農業大學黑龍江省農業科院耕作栽培研究所全國農業碩士專業學位研究生實踐教育示范基地、黑龍江省寒地作物品種改良與生理生態重點實驗室、黑龍江省農學實驗教學示范中心、黑龍江水稻區域技術創新中心。農學院擁有校作物品質分析中心、大豆研究所、玉米研究所、水稻研究所、小麥研究所、馬鈴薯研究所、農藥研究所、經濟與雜糧作物研究中心。農學院是全國馬鈴薯專業委員會掛靠單位，《中國馬鈴薯》雜志承辦單位和黑龍江省植物病理學會掛靠單位，國家農業部農藥登記田間藥效試驗認證單位，農業部除草劑活性室內檢測資質單位。

農學院擁有作物學博士點和植物保護碩士點省級重點一級學科，作物學下設作物遺傳育種學、作物栽培學與耕作學、種子科學與工程、作物生理與生態4個二級學科和作物學博士后流動站。植物保護下設農業昆蟲與害蟲防治、植物病理學、農藥學、雜草學4個二級學科。作物遺傳育種學、作物栽培學與耕作學是二級博士點學科，其他均為碩士點學科。作物學是綠色食品生產與加工和新型農業裝備制造產業黑龍江省重點學科群組成部分。作物遺傳育種學、作物栽培學與耕作學、植物病理學、農業昆蟲與害蟲防治和農藥學學科是黑龍江省省級領軍人才梯隊，作物遺傳育種學科還是黑龍江省特聘教授崗位學科，2012年遴選為黑龍江省“535工程”第二層次省級領軍人才梯隊。“大豆遺傳育種與分子設計”遴選為教育部創新團隊。2015年楊德光和張淑珍教授分別帶領的“玉米非生物逆境生理與調控創新團隊”和“大豆抗病遺傳育種團隊”獲第二批農業科研杰出人才及其創新團隊”

農學院現有在職教工116人，博士學位教師86人，正高職36人，副高職41人。博士研究生導師31人，碩士研究生導師57人。其中國務院特殊津貼獲得者3人、國務院學位委員會學科評議組成員1人，全國專業學位研究生教育指導委員1人，教育部高等學校教學指導委員會植物生產類教學指導委員會委員1人，世界大豆研究會執行委員會委員和北美大豆遺傳委員會執行組成員及中國作物學會大豆專業委員會副理事長1人，中國作物學會馬鈴薯專業委員會秘書長1人，兼職院士2人，科技部中青年領軍人才1人，農業部現代農業產業技術體系崗位科學家3人，農業科研杰出人才2人，龍江學者3人，教育部新世紀人才基金獲得者2人，黑龍江特殊津貼獲得者2人、黑龍江省杰出青年基金獲得者3人，香江學者1人，黑龍江省二級教授6人，黑龍江省長江學者后備支持計劃獲得者2人，黑龍江省新世紀人才4人，黑龍江省教育廳骨干教師8人，黑龍江省普通高等學校青年創新人才2人。東農“杰出學者”2人、“學術骨干”8人、青年才俊8人。

“ 十二五”以來，學院承擔國家轉基因生物新品種培育重大專項、國家973計劃、國家863計劃、國家科技支撐計劃、國家攻關課題、國家自然基金、現代產業技術體系崗位專項及省部級科研課題170余項，研究經費達1.1億元。獲國家科技進步二等獎1項，黑龍江省科技進步一等獎2項、二等獎5項，教學成果獎3項。獲發明專利40項，審定品種30余個，品種保護權8個，制定行業標準2部，發表論文700余篇，其中SCI收錄100余篇，出版學術專著32部。

農學院開設農學、植物保護、種子科學與工程、植物科學與技術4個本科專業和1個農學專業本碩博連讀班，其中農學和植物保護專業為省級重點專業，農學專業為國家特色專業。農學院現有本科生1659人。2010年“有害生物綜合治理”教學團隊評為省級教學團隊，農學院還在中國農科院植保所、黑龍江省農科院、吉林大學植物科技學院等校內外設有多處教學實習基地。 “十二五”以來學院教師承擔各類教改課題45項。教師獲省級各類教學成果獎24項，教師發表教學研究論文100余篇，出版各類統編教材70部，主編校內教材100部，獲校級精品課16門，省級精品課1門。

目前，農學院現有學術型碩士研究生319名，專業型碩士研究生24名，農業推廣碩士研究生100余名，博士研究生74名、博士后42人。2005年和2015年作物學博士后流動站兩次連續被評為國家優秀博士后流動站。農學院獲得全國農業推廣碩士優秀論文1篇，黑龍江省優秀碩士論文4篇，“寒地作物遺傳育種”研究生導師團隊入選黑龍江省第二屆優秀研究生導師團隊，并在2013年成功舉辦了作物分子育種技術全國研究生暑期學校。

農學院畢業生分布在全國各地的農業管理部門、科研院所、大專院校、農業企事業單位和農業推廣部門，從事管理、科研、教學和推廣工作。

農學院一貫注重國際合作與學術交流，通過舉辦國際和國內學術會議搭建學術交流平臺，在加強交流的同時擴大了農學院的影響。每年派出2-3人出國留學或訪學，5-10人參加國際會議及短期出國考察訪問。近期邀請和接待了來自美國、加拿大、日本、韓國、英國及國內重要科研院所和高校的訪問學者100多人次來院進行學術交流，也通過承擔國際科研合作研項目與國際高水平的科研單位達到密切的交流與合作。

近年來，農學院派出4名科技副縣（市）長、2名科顧問和6名科技副鄉（鎮）長帶著課題和項目深入到全省農業生產一線，與拜泉縣、肇州縣、嘉蔭縣、嫩江縣、望奎縣、大興農場、852農場等建立了合作共建關系。通過新農村發展研究院在農墾建三江、紅興隆管理局建立了水稻、玉米、大豆子技術集成與示范區，促進我校科技成果推廣轉化。農學院每年組織50名左右專家與科技人員，培訓農民、農技人員、農村鄉鎮干部，推廣科技成果，為三農服務。

農學院為黑龍江省“科教興省”和“富民強省”戰略及“千億斤糧食”產能工程實施做出了巨大貢獻，向全國農業戰線輸送大批人才和提供強有力的科技支撐，農學院多次受到黑龍江省主要領導和部門的關懷和鼓勵。

追風趕月向未來，春華秋實在農學，在這片充滿靈氣而又神奇黑土地上，東北農業大學農學院必將會創造一個更加輝煌的明天，譜寫更加絢麗的華章。