物理與光電工程學院成立于2019年，前身是1953年建校的中國人民解放軍軍事工程學院（哈軍工）的物理教授會，歷經基礎部、物理部、物理系、理學院，2019年1月成立物理與光電工程學院。現有“光學工程”一級博士點和“物理學”一級碩士點， “光學工程”以及碩士點，“光學工程”博士后科研流動站，學院擁有“纖維集成光學”教育部重點實驗室、“面向工程應用的微結構功能光纖”教育部創新引智基地、“光纖傳感科學與技術”黑龍江省重點實驗室等先進科研平臺和“大學物理實驗”國家級實驗教學示范中心。

學院現有教職工93人，具有高級職稱的教師52人。其中百千萬國家級人選1人、國家杰青1人、國家優青1人、教育部新世紀人才3人、黑龍江省杰青2人、龍江學者3人、省級教學名師3人、黑龍江省骨干教師2人、省級教學新秀1人、校終身示范主講教師1人。學院現有博士生導師20人，碩士生導師37人。學院聘請中國工程院院士崔向群教授、英國皇家工程院院士K.T.V. Grattan教授等7位專家為博士生導師；聘請北京郵電大學原校長林金桐教授等16位學者任兼職教授；聘請澳大利亞兩院院士顧敏教授、加拿大皇家科學院院士鮑曉毅教授等6位任海外高端專家。

學院秉承“志存高遠、自強不息、求真務實、勵學利民”的學院辦學方針和“夯實理學、強大工學、理工結合、協同發展”的指導思想，堅持“視野寬、基礎厚、能力強、素質優”的人才培養目標，致力于培養信念堅定、人格健全、樂于探索、務實篤行的一流工程師、行業領軍人才和科學家。近年來，共承擔國家自然國家、省部級項目等104項（其中國家自然科學基金44項），經費總額9900余萬元，包括：科技部國家重大儀器開發專項、科技部國際合作重大項目、國家自然科學基金委重點項目、國家自然科學基金委重大項目（課題）等，共獲得省部級獎4項，其中黑龍江省科學技術一等獎2項，二等獎3項。