學院校區位于上海市青浦區徐涇鎮蟠龍路200號，占地面積520畝，建筑面積約為8.7萬平方米，工程建設總投資8.08億元人民幣。校園三面環水，景色怡人，綠化覆蓋率高達64.6％。學院在上海財經大學中山北一路校區還設有培訓分部。

1995年6月22日，時任國務院副總理朱镕基在有關國家會計學院基地建設的批示中指出：“舉辦注冊會計師培訓中心很有必要，這是根據江澤民同志關于要培養30萬注冊會計師的指示提出來的。這是千秋萬代的事業，是為社會主義市場經濟奠基的一件極為重要的事情。”2000年9月，在朱總理的親自關懷和指導下，上海國家會計學院正式組建，成為全國性的企業高管、經濟管理干部、注冊會計師、總會計師（財務總監）的職業后續教育基地。2001年4月16日，一向惜墨如金的朱镕基總理在視察上海國家會計學院時，題寫了著名的“不做假帳”的校訓。建院以來，以財政部為堅強后盾，在各級領導的關懷和指導下，在社會各界的大力支持下，上海國家會計學院歷經艱苦創業，積極探索高級財金、會計人才的教育規律，適應經濟社會發展對高端人才的需求和會計行業發展戰略，面向國家宏觀經濟部門、國有大中型企業、金融機構和中介機構等開展高層次繼續教育，形成了清晰的辦學思路、辦學模式以及短期培訓、學位教育、遠程教育“三足鼎立”的事業格局，在教育界形成了相當的影響力和知名度，被譽為會計人員的“精神家園”。截至目前，學院已累計舉辦短期培訓、學位教育、遠程教育、國際培訓等各類項目5100多班次，培訓學員近40萬多人次，這樣的培訓規模在全國的教育機構中是不多見的。