云南農業大學動物科學技術學院創辦于1950年，前身為國立云南大學農學院畜牧系，1960年設立云南畜牧獸醫學院，1961年合并至昆明農林學院成立小哨分院，1964年遷至昆明農林學院本部（現址）成立畜牧獸醫系，1969年搬遷至大理州賓川縣，1970年遷至原曲靖地區尋甸縣，1971年成立云南農業大學畜牧獸醫系，1979年遷回現址。1995年成立云南農業大學動物科學技術學院。

學院長期立足云南獨具的畜禽、水產、蜜蜂和飼草飼料資源，圍繞經濟社會和畜牧業發展需求，堅持人才培養、科學研究與社會服務協調發展，已發展成為云南省唯一具有“本-碩-博”培養體系的畜牧業人才培養基地和重要的畜牧業科技中心，為邊疆經濟社會和畜牧業發展提供了重要的人才和智力支持。

現有教職工76人，其中正高級職稱23人、副高級職稱21人，具有博士學位49人，碩士學位20人，博士生導師14人，碩士生導師43人。全日制在校生1241人，其中本科生959人、博士生70人（包括6名留學生）、碩士生212人。有省級教學團隊2個、省級科技創新團隊3個、省高?？萍紕撔聢F隊2個；省級學術技術帶頭人17人、云南省現代農業產業技術體系首席科學家3人、國家蜂產業技術體系崗位科學家1人。

學院現有動物科學、草業科學、蜂學、水產養殖學4個本科專業（其中動物科學專業為國家級特色專業、省級品牌專業、省級重點專業，蜂學專業為省級特色專業）；擁有5個省級重點學科，1個國家級一級學科博士后科研流動站（畜牧學）、1個省級一級學科博士后科研流動站（草學）、2個一級學科博士授權點（畜牧學、草學）、2個一級學科碩士授權點（畜牧學、草學）、3個二級學科博士授權點、5個二級學科碩士授權點、2種專業碩士學位授權點。2017年，動物科學首次進入ESI全球排名1%的學科?，F有省級重點實驗室2個、省級實驗教學示范中心1個、省級工程技術研究中心2個。

2015年以來，先后獲準立項國家及省級“質量工程”項目33項（國家級4項、省級29項），承擔校級以上教學改革研究項目30余項。共主編及參編教材45部；申報獲準國家及省部級科技項目、企業橫向項目180余項；獲省部級科技成果獎勵15項（其中一等獎3項、二等獎2項、三等獎10項）、省級教學成果一等獎1項。培育的宣和豬新品種通過國家畜禽新品種審定。

辦學70年來，學院累計為社會培養了11000余名畢業生，為云南邊疆民族人才培養及本土畜牧業人才整體素質提升做出了重要貢獻；所取得的一批重要科技成果，為高原特色畜牧業發展提供了有力的技術支撐。