中山大學深圳校區是中山大學“三校區五校園”的重要組成部分，以醫科和新型工科為重點。中山大學公共衛生學院（深圳）作為首批建設學院，將傳承和弘揚中山大學“學在中大，追求卓越”的校風學風，與位于廣州校區的公共衛生學院“錯位發展”，面向我國和全球在公共衛生與預防醫學教育、疾病防控和全民健康等方面的巨大需求，聚焦交叉學科與前沿學術研究，以傳染病特別是新發傳染病的病原學、流行病學和檢測技術、疫苗及藥物等防控技術為重點，建設成為以傳染病防控為特色，專業齊全、國內領先、國際一流的現代化公共衛生學院。

學院堅持中國特色社會主義辦學方向，以立德樹人為根本，以“德才兼備、領袖氣質、家國情懷”為人才培養目標，秉承“以一流的科研支撐一流的教學，以一流的教學促進一流的科研”的發展思路，重點建設傳染病關鍵理論和防控技術平臺、流行病和系統生物學研究平臺以及食品安全關鍵理論和防控技術平臺三大平臺；同時，平行建設勞動衛生與環境衛生學、兒少衛生與婦幼保健學以及衛生毒理學等研究平臺。通過科學研究、人才培養和社會服務等方面，為我國乃至全球傳染病防控提供理論和技術支撐，培養新時代公共衛生精英人才。