2003年4月經國家教育部批準，由原江漢石油學院、湖北農學院、荊州師范學院、湖北省衛生職工醫學院合并組建長江大學，成立計算機科學學院。學院現有“計算機科學與技術”和“軟件工程”2個一級碩士學位授予權和“計算機技術”1個工程碩士點；有“計算機科學與技術”、“網絡工程”、“軟件工程”、“物聯網工程”、“信息安全”等5個本科專業和軟件工程實驗班，其中，“計算機科學與技術”學科為湖北省“十二五”重點學科（特色學科）。目前在校本科生、國內外研究生2200余人。

學院下設計算機科學與技術系、網絡工程系、軟件工程系、物聯網工程系和大學計算機教學部等教學機構，分別負責本學院的專業教學和全校計算機公共課教學。學院現有與北京侏羅紀軟件股份有限公司共建的長江大學資源信息應用技術研究所、長江大學油藏信息研究所、與荊鵬軟件集團共建的錄井技術研究所等三個研究機構，學院擁有大數據應用技術研究團隊、物聯網智慧應用技術團隊、網絡安全研究團隊及圖形圖像技術研究團隊。目前全院教職員工104人，其中正高職稱10人，副高職稱41人；具有博士學位教師20人，碩士學位教師67人，在讀博士7人；碩士生導師24人，楚天學者講座教授1人。

學院設有計算機實驗教學中心和交互式多媒體實驗中心等2個中央與地方共建的實驗中心，內設硬件技術實驗室、嵌入式系統實驗室、軟件工程實驗室、網絡工程實驗室、虛擬現實實驗室、綜合布線中心、移動互聯實驗室、信息安全實驗室和云計算與大數據實驗室等，能滿足各專業計算機軟、硬件實驗和網絡實驗、課程設計、畢業設計等教學要求和教師從事科學研究的基本需要。正在建設的校企合作實驗室有蘋果創新實驗室、可穿戴創新實驗室和3D打印、機器人等創新創業中心。與荊州市科技局合作共建“物聯網大數據實驗室開放中心”。通過實驗室和學科平臺建設，學院在計算機檢測與控制、嵌入式系統、數據庫技術及應用、數據處理與可視化技術、網絡技術與信息安全、石油應用軟件開發、油藏與資源信息處理等方面形成了特色顯著的研究方向，并逐步趨于穩定。

學院建院以來，傳承原4個學校的優良傳統和辦學理念，始終堅持以教學質量為生命線、以學科建設為龍頭、以師資隊伍建設為核心、以科研為先導、以專業建設為主線、以課程建設為重點、以實驗室和實踐性環節建設為保障，不斷提高人才培養質量。建院以來，畢業生考研率不斷上升，并有一批學生考取中國科學院、北京大學、武漢大學、華中科技大學等名校（院）的研究生。學生在全國大學生數學建模、計算機仿真大賽、英語競賽、電子設計大賽、嵌入式大賽中多次獲獎。近五年來，學院承擔國家自然科學基金、湖北省自然科學基金、湖北省教育廳重大科研項目、國家重大科技專項及各種企事業委托項目120余項，年科研經費800余萬元，獲省（部）級科技成果獎6項，公開出版著作、教材30余部，發表論文600余篇，獲各類知識產權授權50余項。