船舶與海洋工程學院的前身造船系是1959年4月18日受海軍委托而創(chuàng)建（朱九思院長曾兼首任系主任）。經(jīng)劉穎、程天柱、鄭際嘉等船舶領(lǐng)域知名專家以及一批批科技人員的辛勤工作而發(fā)展至今。1980年，造船系改名為船舶工程系，1984年改名為船舶與海洋工程系，1997年，以船舶與海洋工程學科為主體，成立交通科學與工程學院。2008年4月8日，華中科技大學船舶與海洋工程學院正式成立。

學院分別于1981年、1984年獲得碩士學位、博士學位授予權(quán)，是全國第一批有學位授予權(quán)的學科點，1995年建立船舶與海洋工程博士后流動站，1998年船舶與海洋工程被批準為湖北省重點學科，1990年獲輪機工程碩士授予權(quán)，2000年獲一級學科博士、碩士學位授予權(quán)，2007年，船舶和海洋水動力實驗室獲批湖北省重點實驗室（籌），2008年船舶與海洋結(jié)構(gòu)物設(shè)計制造被批準為省重點學科，2010年，“船舶和海洋水動力湖北省重點實驗室”通過驗收。2013年，獲批“船舶與海洋工程”一級學科湖北省重點學科。2014年，參與上海交通大學牽頭的“高新船舶與深海開發(fā)裝備協(xié)同創(chuàng)新中心（2011計劃）”獲得教育部、財政部認定。2015年，參與上海交通大學牽頭的“中國海洋裝備工程科技發(fā)展戰(zhàn)略研究院”獲得中國工程院批準。2016年，獲批國防科工局“船舶設(shè)計與制造”主干類國防特色學科。2017年，參與中船重工750試驗場牽頭的“海洋工程裝備檢測試驗技術(shù)國家工程實驗室”獲得國家發(fā)改委認定。2018年，“船舶數(shù)據(jù)技術(shù)與支撐軟件湖北省工程研究中心”獲得省發(fā)改委認定。學院是兩大國際組織ITTC和ISSC的成員單位。

學院現(xiàn)設(shè)有船舶與海洋工程、輪機工程2個本科專業(yè)，船舶與海洋結(jié)構(gòu)物設(shè)計制造、輪機工程、水下工程三個碩士點和博士點。目前學院有教職工50余人，其中教授10人，副教授22人，在校學生1千余人。學院曾獲國家科技進步一、二等獎4項，省級科技進步特等獎1項，一、二、三等獎30余項。