生物與食品工程學(xué)院始建于1984年，歷經(jīng)食品工程系、生物化學(xué)工程系和生物與化學(xué)工程學(xué)院。是安徽工程大學(xué)最早的四個教學(xué)單位之一。學(xué)院在30多年的發(fā)展歷程中，秉承“尚德敏學(xué)、唯實惟新”的校訓(xùn)精神，以本科生教育為主，大力發(fā)展研究生教育，緊密結(jié)合專業(yè)服務(wù)地方社會經(jīng)濟發(fā)展，為“國內(nèi)知名、省內(nèi)一流的地方特色高水平大學(xué)”建設(shè)提供強力支撐。

生物與化學(xué)工程學(xué)院現(xiàn)有食品科學(xué)與工程、生物工程、化學(xué)工程與工藝、生物技術(shù)、環(huán)境工程、應(yīng)用化學(xué)、高分子材料與工程以及生物制藥8個本科專業(yè)，擁有生物工程（學(xué)術(shù)、專業(yè)）、食品科學(xué)與工程、環(huán)境科學(xué)與工程、化學(xué)4個一級學(xué)科碩士點，微生物學(xué)二級學(xué)科碩士點。發(fā)酵工程為省級重點學(xué)科，生物工程（輕工技術(shù)與工程）、環(huán)境科學(xué)與工程、應(yīng)用化學(xué)（化學(xué)）、食品科學(xué)與工程、微生物學(xué)為校級重點學(xué)科，其中生物工程為校級博士立項支撐學(xué)科，并擁有微生物發(fā)酵安徽省工程技術(shù)研究中心等6個省級研究平臺和1個省級科研創(chuàng)新團(tuán)隊。

學(xué)院現(xiàn)有教職工123人，其中具有高級職稱68人，占教職工比例為61.8%，具有博士學(xué)位（含在讀博士）的教師79人，占教職工比例為64.23%；碩士生導(dǎo)師63人（其中校外導(dǎo)師15人），其中省級名師工作室1人，省級教學(xué)名師3人，省優(yōu)秀教師1人，省級教壇新秀4人。并聘請中國科學(xué)院吳奇院士、清華大學(xué)邢新會教授等一批國內(nèi)外知名學(xué)者擔(dān)任兼職教授和碩士生導(dǎo)師。現(xiàn)有全日制本科學(xué)生、研究生2750多人。

學(xué)院畢業(yè)生就業(yè)率多年在95%以上，考研率一直居于學(xué)校前列，現(xiàn)已向社會輸送畢業(yè)生9000余名。廣大教師積極開展教學(xué)與科學(xué)研究，近年來先后主持國家自然科學(xué)基金、國家農(nóng)業(yè)科技成果轉(zhuǎn)化資金等國家級科技項目40余項，安徽省科技攻關(guān)、安徽省自然科學(xué)基金等省級科技項目80余項，獲省部級科技進(jìn)步獎一等獎1項、二等獎4項、三等獎10項，獲授權(quán)發(fā)明專利80余項，發(fā)表SCI和EI收錄論文300余篇。

學(xué)院積極貫徹學(xué)校“質(zhì)量立校、人才強校、特色與和諧興校”的辦學(xué)理念和“誠實做人、踏實做事、扎實做學(xué)問”的育人理念，創(chuàng)建應(yīng)用化學(xué)“拔尖班”。大力開展創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育，舉辦各類學(xué)科競賽、校園啤酒節(jié)、三民晚會等課外科技文化活動，拓展學(xué)生第二、第三課堂。近5年來，多人次在全國節(jié)能減排大賽、全國化工設(shè)計大賽等學(xué)科與技能競賽中獲獎，連續(xù)5年本科生一次性就業(yè)率均為96%以上，考研升學(xué)率達(dá)20%以上，CET-4合格率為72.4%，省級計算機二級通過率為98.23%。

目前，學(xué)院正在向“深化內(nèi)涵建設(shè)、做強生化學(xué)院”的總體目標(biāo)邁進(jìn)。