物流工程學院由機械工程系、電氣自動化系、工業(yè)工程系、中荷機電工程學院（中荷機電工程系）、產教融合中心、機械工程實驗中心和電氣自動化實驗中心組成。

學院現(xiàn)有電氣工程博士后流動站，電氣工程一級學科博士點，工業(yè)工程二級學科博士點，機械工程、電氣工程和控制科學與工程3個一級學科碩士點，管理科學與工程一級學科下自設人工智能系統(tǒng)與應用二級學科碩士點，機械（機械工程）、能源動力（電氣工程）和工程管理（物流工程與管理）3個工程碩士專業(yè)學位領域，以及機械設計制造及其自動化、機械電子工程（物流裝備控制與安全）、電氣工程及其自動化、自動化、測控技術與儀器、工業(yè)工程、物流工程、機械電子工程（中荷合作）和電氣工程與智能控制（中荷合作）等9個本科專業(yè)。學院參與上海海事大學高峰學科“管理科學與工程（物流工程與管理）”——“港航物流系統(tǒng)智能化與綠色化”特色研究方向建設，并且參與上海高水平地方高校創(chuàng)新團隊“管理科學與工程”——“先進物流裝備管理與工程”方向重點創(chuàng)新團隊的建設。機械設計制造及其自動化專業(yè)列入教育部“卓越工程師教育培養(yǎng)計劃”，并且通過中國工程教育認證；物流工程、工業(yè)工程、機械設計制造及其自動化3個專業(yè)獲評國家級一流本科專業(yè)建設點；電氣工程及其自動化、機械電子工程（物流裝備控制與安全）個專業(yè)獲評上海市級一流本科專業(yè)建設點；工業(yè)工程專業(yè)實踐教學研究虛擬教研室獲批全國性虛擬教研室，這是我校第一個教學研究改革專題類全國性虛擬教研室；智慧港口裝備虛擬教研室獲批上海市首批市級虛擬教研室建設試點。

學院現(xiàn)有教職員工179名，專任教師134名，其中正高級職稱18名，副高級職稱47名。學院師資力量雄厚，匯聚了一批在相關行業(yè)領域解決行業(yè)重大攻關難題的專家和在學術領域做出創(chuàng)新性研究成果和貢獻的學者，包括上海市多項人才計劃等40余人次。

學院先后獲得國家科技進步獎二等獎1項， 國家級學會獎20余項，省部級科技成果獎20余項。承擔國家863項目、國家自然科學基金重點基金、國家科技部-國家重點研發(fā)計劃等課題72項，政府及企事業(yè)單位委托的科研總經費達3.4億元。發(fā)表學術論文2200余篇，其中SCI、EI檢索收錄1000余篇。國家專利授權170余項，其中發(fā)明專利授權80余項。學院自主研發(fā)的NetCMAS-起重機械監(jiān)評系統(tǒng)及信息物理平臺通過工業(yè)4.0合規(guī)性評估，這也是國內頒發(fā)的第一張歐盟工業(yè)控制系統(tǒng)安全等級合規(guī)認證書。形成了一系列國家級和省部級科研成果，為工業(yè)界解決了許多應用難題，在相應的學科領域和工業(yè)界里享有良好的聲譽。學院與上海國際港務集團、振華重工集團、上汽集團、德國TUV、等許多國內外著名企業(yè)有著長期密切的產學研合作關系，與法國南特大學、法國海軍學院、波蘭格丁尼亞海事大學等有著廣泛的科研合作。

圍繞特色學科發(fā)展需求，學院已建成一批先進的教學、科研平臺和高水平實驗室，包括“現(xiàn)代港口物流”國家級實驗教學示范中心和“現(xiàn)代港口物流”國家級虛擬仿真實驗中心；集裝箱供應鏈技術教育部工程研究中心、上?！爸悄芎Ｊ滤丫扰c水下機器人”工程技術研究中心、上?！案劭谂c海洋重裝備安全”工程技術研究中心、電力傳動與控制研究所、機械工程設計研究所、港機與海洋工程裝備檢測中心、波浪補償實驗室、“上海海事大學-施耐德電氣聯(lián)合實驗室”、“上海海事大學-美國德州儀器數(shù)字信號處理方案聯(lián)合實驗室”、“海大-漢德港機和海洋工程裝備聯(lián)合實驗室”、海上清潔能源電力系統(tǒng)實驗室、工業(yè)4.0實驗室等。學院還擁有“上海海事大學-上海汽車集團股份有限公司乘用車分公司”工程實踐教育中心和“上海海事大學-上海振華重工（集團）股份有限公司”工程實踐教育中心兩個國家級工程實踐中心，以及“現(xiàn)代港口物流”國家級實驗教學示范中心和“現(xiàn)代港口物流”國家級虛擬仿真實驗中心，這些國家級實踐平臺現(xiàn)已發(fā)展成為學生實踐和創(chuàng)新培養(yǎng)的核心支撐機構。在為工業(yè)界科技服務的過程中，學院也形成了一批面向工程應用的實踐基地，現(xiàn)有研究生實習實踐基地60余個，其中國家級基地1個，校級基地7個，院級基地50余個，為研究生實踐能力的培養(yǎng)提供了充分的保障。

近年來培養(yǎng)學生獲“機械創(chuàng)新設計大賽”“智能汽車競賽”“大學生電子設計競賽”“物聯(lián)網設計競賽”“中國智能制造挑戰(zhàn)賽”“工業(yè)工程類專業(yè)課程設計大賽”等全國大學生比賽一等獎榮譽。大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練計劃項目立項達600余項，其中國家級26項。

學院擁有中外合作辦學機構----中荷機電工程學院。2006年經教育部批準，上海海事大學與荷蘭澤蘭德大學聯(lián)合舉辦國際合作辦學項目，包括“電氣工程與智能控制（中荷合作）”以及“機械電子工程（中荷合作）”兩個本科專業(yè)。學院主動適應新時期“一帶一路”建設對教育對外開放的要求，積極開拓與“一帶一路”沿線國家和沿海國家的高等教育合作，與數(shù)十所大學建立了交流與合作關系。

學院秉承“格物致知，知行合一，自強不息，厚德載物”的教育理念，堅持港航和物流學科特色，面向長三角一體化、上海國際科創(chuàng)中心、上海國際航運中心和上海臨港國際制造中心等區(qū)域戰(zhàn)略發(fā)展目標，以工業(yè)4.0與智能制造2025、智慧港口、工業(yè)互聯(lián)網等為應用背景，開展智能制造、物流裝備健康診斷、船舶電力推進等研究，著力提升我國港航物流裝備領域的技術原創(chuàng)能力和核心競爭力，為國家大型港口、航運、物流以及相關企業(yè)提供人才支持和技術支撐，為海上絲綢之路保駕護航。