動物科學技術學院是吉林農業大學歷史最悠久的主干院系之一，是全國首批碩士學位授權單位。學院設有動物科學、動物醫學、水產養殖學、經濟動物學4個系和1個專業基礎教學部。有畜牧學和獸醫學一級學科博士點；有畜牧學和獸醫學2個博士后科研流動站；有動物營養與飼料科學、動物遺傳育種與繁殖科學、特種經濟動物飼養、預防獸醫學、臨床獸醫學、基礎獸醫學、草學7個學術碩士學位授權學科，有畜牧、獸醫和農藝與種業3個專業碩士學位授權學科；有動物科學、動物醫學、水產養殖學、草業科學和野生動物與自然保護區管理5個本科專業。

學院現有教職員工132人，其中教授33人，副教授38人，有博士和碩士生導師70余人。學院現有博士和碩士研究生近600人，全日制本科生1800余人。學院設有國家囊蟲病防治技術研究與推廣中心、國家優良品種鵝基地、動物生產及產品質量安全教育部重點實驗室、吉林省動物營養與飼料科學重點實驗室、吉林省動物微生態制劑工程研究中心、吉林省反芻動物繁育生物技術與健康養殖工程實驗室、吉林省新獸藥研發與創制重點實驗室、吉林省藥用動物實驗室、吉林省飼料工程研究中心、吉林省中醫藥管理局中醫藥科研平臺、吉林省生豬產業技術創新中心、吉林省畜牧業研究開發中心、長春市鵝業研發中心、動物醫學教學實驗中心、生物技術研究所、中獸醫研究所、吉農博瑞奶牛研發中心等教學和科研機構。學院教學設施優良、儀器設備先進，具有承擔所屬各學科科研工作的現代化試驗條件。在科研上，主持國家863、973、科技支撐計劃、跨越計劃、自然基金、科技部星火計劃和農業部、省科技廳等部門的課題多項，獲國家、省部級教學科研成果獎多項。學院的綜合實力位于全省同行業前列。

為滿足市場對人才培養的需求，學院與東北、華北地區30多個科研院所、公司企業建立了聯合辦學董事會，各專業本科生一次性就業率在96％以上。