馬克思主義學院，是在1952年建校時原政治教研組基礎上發展而來的。1954年稱馬列主義教研室，1959年在馬列教研室的基礎上成立了政治教育系。1962年政教系與歷史系合并，馬列主義教研室單設建制。1963年政史系又分為政教系和歷史系，馬列主義教研室又并入政教系。“文革”期間，教學工作中斷。1971年，工農兵學員入校后，又恢復了馬列主義教研室建制，并開展起了教研活動。

1986年原德育教研室并入馬列主義教研室，同時改稱馬列主義教學研究部，下設教研室。1993年原思想政治教研部并入馬列主義教研部，并成立黨總支委員會。2000年內蒙古教育學院并入內蒙古師范大學時，兩校馬列主義教研室（部）合并。2006年11月24日在教研部基礎上成立了馬克思主義學院，成為內蒙古自治區高校成立的首家馬克思主義學院。

馬克思主義學院作為學校二級學院，下設院務辦公室和教務辦公室、馬克思主義中國化理論教研室、馬克思主義基本原理教研室、中國近現代史綱要教研室、思想道德與法律基礎教研室、民族理論教研室、國際問題教研室等6個教研室。內設中國特色社會主義理論研究所、思想政治理論課教學研究所、人才科學研究所等3個研究所。學院設有黨總支委員會，下設3個教工黨支部和1個研究生黨支部。

馬克思主義學院承擔者全校本科生蒙漢語授課思想政治理論課的全部教學任務，負責全校碩士研究生思想政治理論課的教學安排和部分教學任務。根據國家教育部和內蒙古自治區確定的課程方案，本科生開設有：“馬克思主義基本原理概論”、“毛澤東思想和中國特色社會主義理論體系概論”、“中國近現代史綱要”、“思想道德和法律基礎”、“民族理論與民族政策”、“形勢與政策”等6門課。

在現有6門思想政治理論課中，“思想道德修養與法律基礎”、 “民族理論與民族政策”課為自治區級精品課程?！懊珴蓶|思想和中國特色社會主義理論”、“中國近現代史綱要”、“馬克思主義基本原理概論”為校級精品課程。

為了推進思想政治理論課教學實效性，馬克思主義學院廣大教師積極開展了教學研究活動。2005以來，學院承擔了各類教學研究項目18項，其中省部級教學研究項目4項，教育廳項目3項，校級教學研究項目11項。獲得校級教學成果獎12項，其中4項成果獲一等獎，8項成果獲二等獎。有1人次獲得全國思想政治理論課優秀教學能手獎，1人次榮獲全區高校教學技能大賽二等獎，獲得校級中青年教學技能大賽一等獎3人次，二等獎6人次，三等獎8人次。1人被評為全區高?！敖虊滦恪薄W院教師主編全區高校蒙漢文統編教材10余部。

1996年，馬克思主義學院（原馬列主義教研部）獲得“馬克思主義理論：中國社會主義經濟建設”碩士學位授權點，1997年開始招生。之后經過國家學位點調整，目前，馬克思主義學院擁有“馬克思主義基本原理”、“中國近現代史基本問題研究”和“馬克思主義民族理論與政策”3個二級學科碩士學位點的建設。3個二級學科專業下設：馬克思主義哲學與當代、馬克思主義與中國經濟建設研究、思想政治教育與人才培養、內蒙古近現代史基本問題研究、內蒙古近現代社會問題研究、中國民族政策的理論與實踐、族際政治與民族地區民主法制建設等7個研究方向。學院在讀研究生48人。碩士生導師14名。

2005年以來，我院教師發表各類學術論文331篇，出版學術著作12部。主持和完成各級科研項目59項，其中，1項國家社科基金項目；1項國家自然科學基金項目；2項教育部項目；10項自治區規劃項目；15項教育廳項目；30余項校級項目。有8項科研成果獲內蒙古自治區科研和教學優秀成果二等獎，6項成果獲三等獎，另有36項成果獲得教育廳和校級各類教學科研獎。

馬克思主義學院現有教職工39名，專職蒙漢語授課教師37人，專職教師中教授6人，副教授11人，講師和助教18人。獲得博士學位5名，在讀博士4名。40歲以下的教師全部為碩士研究生以上學歷，中共黨員占全體專任教師的90%。

2005年以來，學院教師有5人獲學?！敖虝讼冗M個人”光榮稱號，1人獲得“管理育人”稱號；3人獲愛崗敬業女教師稱號，10人獲優秀共產黨員和優秀黨務工作者稱號，2人獲優秀碩士研究生指導教師稱號。2011年，學院被評為內蒙古師范大學思想政治教育先進集體榮譽稱號。

馬克思主義學院堅持對大學生開展思想政治教育的主渠道不動搖，廣大教師將一如既往做好馬克思主義理論和黨的路線、方針、政策的宣講者，社會主義意識形態和精神文明的傳播者，大學生健康成長的指導者和引路人。